Την επόμενη χρονιά ο ΟΦΗ ξανάφτασε στα ημιτελικά όπου αγωνίστηκε κόντρα στον Ολυμπιακό και αποκλείστηκε χάνοντας 3-0 στο Καραϊσκάκη και κερδίζοντας με 1-0 στο Ηράκλειο. Στο πρώτο παιχνίδι που έγινε στις 30/3/88 στο Καραισκάκη ο Ολυμπιακός νίκησε με 3-0 με γκολ των Φούνες (4` και 41` με πέναλτι) και Ξανθόπουλου (79`). Ο ΟΦΗ είχε παράπονα από τον διαιτητή Γερμανάκο που στο 2-0 απέβαλε τον Τσινό. Η κρητική ομάδα είχε αγωνιστεί με τους Λαφτσή, Πατεμτζή, Τσίμπο, Τσινό, Ανδριανίδη, Ίσις, Περσία, Παπαβασιλείου, Χαραλαμπίδη, Νιόπλια (80` Βέρα) Σαμαρά και ο Ολυμπιακός που είχε προπονητή τον Γρηγοριάδη με τους Ταληκριάδη, Αποστολάκη, Χατζίδη, Αλεξίου, Μπανιώτη, Τσαλουχίδη, Τσιαντάκη, Ξανθόπουλο, Φούνες, Μητρόπουλο(73` Μπονόβα) Σοφιανόπουλο (77` Μουστακίδη). Στη ρεβάνς που έγινε στο Γεντί Κουλέ στις 20/4/88 ο ΟΦΗ πέτυχε νίκη άνευ αντικρίσματος με 1-0 με γκολ του Νιόπλια στο 85`και ο Ολυμπιακός πήρε την πρόκριση για τον τελικό όπου αντιμετώπισε τον Παναθηναϊκό και έχασε στα πέναλτι με 4-3. Στο παιχνίδι του Ηρακλείου ο ΟΦΗ είχε παραταχθεί με τους Λαφτσή, Γκουλή, Τσίμπο (56` Νιόπλια), Ίσις, Ανδριανίδη, Πατεμτζή, Αθανασιάδη (46` Σαμαρά) Βέρα, Χαραλαμπίδη, Παπαβασιλείου, Βλαστό και ο Ολυμπιακός με τους Ταληκριάδη, Αποστολάκη, Χατζίδη, Αλεξίου, Μπανιώτη, Τσαλουχίδη, Μουστακίδη, Ξανθόπουλο, Φούνες (85` Παχατουρίδη) Μητρόπουλο (75` Τσιαντάκη) Μπονόβα.