Με τις ομάδες της Κρήτης να αγωνίζονται μεταξύ τους ξεκινάει στις 16 Οκτωβρίου το κύπελλο της Γʼ Εθνικής. Ο Εργοτέλης θα παίξει εκτός με το ΙΝΚΑ ενώ ο ΠΟΑ θα φιλοξενήσει τον Ερμή.

Το πρόγραμμα έχει ως εξής:

1η αγωνιστική (16/10)

Ρόδος-άλυσος (16)

Ατσαλένιος-Ερμής Ζωνιανών (17)

ΑΕΕΚ ΙΝΚΑ-Εργοτέλης (18)

Κηφισιά-Προοδευτική (19)

Ηλυσιακός-Ιωνικός (20)

Άγιος Ιερόθεος-Θύελλα Ραφήνας (21)

Τριγλία Ραφήνας-Εθνικός (22)

Πανθηραϊκός: Περνάει στην επόμενη φάση χωρίς παιχνίδι

2η αγωνιστική (13/11)

Νικητής 21-Νικητής 22 (23)

Νικητής 18-Νικητής 19 (24)

Πανθηραϊκός-Νικητής 16 (25)

Νικητής 20-Νικητής 17 (26)

3η αγωνιστική (14/12)

Νικητής 23-Νικητής 24 (27)

Νικητής 25-Νικητής 26 (28)

Τελικός σε ουδέτερη έδρα (22/2/2017)

Νικητής 27-Νικητής 28

Στα ημιτελικά θα πάρουν μέρος οι τέσσερις κυπελλούχοι των ομίλων με γεωγραφικά κριτήρια.

Θα διεξαχθούν δύο μονοί αγώνες (29/3) σε ουδέτερα γήπεδα που θα οριστούν από την Επιτροπή Κυπέλλου, όπως και ο τελικός της διοργάνωσης.