Όπως είναι γνωστό, το Μουσείο Εθνικής Αντίστασης άνοιξε τις πύλες του το 1992 σε υπόγειο χώρο στην οδό Δουκός Μποφώρ, με δωρεές που έκαναν συμπολίτες μας για να στηρίξουν τη λειτουργία του. Το σπουδαίο αυτό υλικό συγκεντρώθηκε με πολύ κόπο και προσπάθεια, καθώς οικογένειες συμπολιτών μας, για να τιμήσουν τη μνήμη των νεκρών τους που θυσιάστηκαν στον αντιφασιστικό αγώνα την περίοδο της Κατοχής, δώρισαν στο Δήμο Ηρακλείου τα πολύτιμα κειμήλιά τους με σκοπό να εκτεθούν και η τοπική κοινωνία αλλά και οι επισκέπτες της πόλης να γνωρίσουν την ιστορία του Ηρακλείου. Εκθέματα του Μουσείου αποτελούν χίλιες, -ή οι περισσότερες αυθεντικές, φωτογραφίες - εικόνες από τη Μάχη της Κρήτης και την Εθνική Αντίσταση, διακόσια περίπου βιβλία, μονογραφίες, μελέτες των ιστορικών γεγονότων από το 1941 έως το 1945, εκτοντάδες έγγραφα και διάφορα δημοσιεύματα τύπου. Επίσης περιλαμβάνονται ποικίλα πολεμικά αντικείμενα (όπλα, εξαρτήματα, στολές, αντικείμενα καθημερινής χρήσης κ.λ.π.). Δύο χρόνια μετά τη λειτουργία του ο χώρος όπου στεγαζόταν το Μουσείο πλημμύρισε από νερά και αποδείχτηκε ακατάλληλος για τη χρήση αυτή. Έκτοτε οι πόρτες του Μουσείου έκλεισαν και πολλά χρόνια αργότερα όλο το υλικό μεταφέρθηκε και εγκαταλήγφθηκε μέσα σε κούτες στη στοά Μακάσι, όπου υπέστη απίστευτες καταστροφές από την υγρασία . Μέσα στα χρόνια που προηγήθηκαν υπήρξαν έντονες αντιδράσεις από τους συμπολίτες μας που είχαν παραχωρήσει τα πολύτιμα αντικείμενα τους για τις ανάγκες του Μουσείου, τα οποία ζητούσαν πίσω καθώς ο Δήμος Ηρακλείου δεν έδειχνε κανένα ενδιαφέρον για την επαναλειτουργία του.