Στο Ευρωπαϊκό Πανεπιστήμιο Κύπρου λειτουργούν

4 σχολές με 9 τμήματα:

1. Σχολή Ανθρωπιστικών και Κοινωνικών Επιστημών

- Τμήμα Ανθρωπιστικών Επιστημών

- Τμήμα Κοινωνικών Επιστημών και Επιστημών Συμπεριφοράς

- Τμήμα Νομικής

2. Σχολή Διοίκησης Επιχειρήσεων Ιωάννη Γρηγορίου

- Τμήμα Λογιστικής, Οικονομικών και Χρηματοοικονομικών

- Τμήμα Διοίκησης και Μάρκετινγκ

3. Σχολή Θετικών Επιστημών

- Τμήμα Πληροφορικής και Μηχανολογίας

- Τμήμα Επιστημών Υγείας

4. Σχολή Τεχνών και Επιστημών Αγωγής

- Τμήμα Τεχνών

- Τμήμα Επιστημών της Αγωγής