Με βάση το Προεδρικό Διάταγμα ο σχεδιασμός ανάδειξης ενός εκ των δύο μνημείων του πλατάνου ή του ιστορικού μνημείου της “Μεγάλης Βρύσης”, λαμβάνει υπόψη την προστασία του άλλου μνημείου.

Βασικοί άξονες διαχείρισης του διατηρητέου μνημείου είναι:

- Η διατήρηση του αιωνόβιου δέντρου και η προστασία του από επεμβάσεις στον κορμό, το ριζικό σύστημα καθώς και από παρεμβάσεις στην υδρολογική κατάσταση και την περιβάλλουσα ζώνη προστασίας

- Η αξιοποίηση του για την αναψυχή των κατοίκων και επισκεπτών, αποκλειστικά μέσω της χρήσης του υπόσκιου χώρου και όχι με οποιονδήποτε άλλον τρόπο ή μέσο αναψυχής που ενδέχεται να βλάψει το δέντρο και την περιβάλλουσα ζώνη προστασίας

- Το μνημείο να αποτελεί σημείο αναφοράς δραστηριοτήτων περιβαλλοντικής εκπαίδευσης.

Για τη διατήρηση και προστασία του μνημείου επιβάλλονται οι εξής όροι, περιορισμοί και απαγορεύσεις:

- Κανένα δημοτικό έργο ή διαμόρφωση του χώρου δεν επιτρέπεται χωρίς την έγκριση της αρμόδιας υπηρεσίας του άρθρου 5 και της Αρχαιολογικής Υπηρεσίας σε ό,τι αφορά τις κρήνες

- Κανένα οδικό έργο ή βαθιά εκσκαφή για διέλευση υπόγειων αγωγών και δικτύων, που μπορεί να επηρεάσουν το ριζικό σύστημα του δένδρου ή την υδρολογική κατάσταση, δεν επιτρέπονται χωρίς την έγκριση της αρμόδιας υπηρεσίας του άρθρου 5

- Με άδεια χρήσης νερού της αρμόδιας υπηρεσίας (Δ/νσης Υδάτων Περιφέρειας Κρήτης) καθορίζεται η ελάχιστη και σταθερή οικολογική παροχή για τις ανάγκες άρδευσης του δένδρου από τις πηγές. Δεν επιτρέπεται η διακοπή ή εκτροπή αυτής της παροχής για άλλους σκοπούς, ειδικά κατά τη διάρκεια της κρίσιμης θερινής περιόδου

- Δεν επιτρέπεται η ανάρτηση διαφημιστικών πινακίδων, καλωδίων και φωτιστικών στον κορμό και τους κλάδους του δένδρου

- Δεν επιτρέπεται η στάθμευση οχημάτων στην περιβάλλουσα ζώνη προστασίας του πλατάνου

- Ο φωτισμός της πλατείας και του δένδρου επιβάλλεται να είναι επαρκής και διακριτικός και δεν επιτρέπεται οι προβολείς να στρέφονται προς την κόμη του δένδρου, ώστε να μην προκαλούν όχληση σε πτηνά που φωλιάζουν ή κουρνιάζουν στο δένδρο

- Δεν επιτρέπεται η αναρρίχηση στον κορμό και τους κλάδους

- Τυχόν απαιτούμενες κλαδεύσεις ή καθαίρεση επικίνδυνων κλάδων γίνεται μόνο με την εποπτεία της αρμόδιας υπηρεσίας του άρθρου 5

- Επιτρέπεται η τοποθέτηση τραπεζοκαθισμάτων στην επιφάνεια της πλατείας αλλά σε απόσταση μεγαλύτερη των 3 μέτρων από τον κορμό ώστε να μην εμποδίζεται η κυκλοφορία των επισκεπτών, η παρατήρηση και η φωτογράφηση του κορμού.

Τέλος, το Προεδρικό Διάταγμα προβλέπει τη βελτίωση της υδρολογικής κατάστασης του, την αποκάλυψη τμήματος του κορμού, τη διαμόρφωση φωτισμού της πλατείας κ.ά.