Η χρηματοδότηση του έργου του βιολογικού του Ηρακλείου γίνεται από τον χρηματοδοτικό μηχανισμό του ευρωπαϊκού οικονομικού χώρου. Η Ισλανδία, το Λιχτενστάιν, η Νορβηγία και η Ελβετία δημιούργησαν το 1960 την Ένωση Ευρωπαϊκού Ελεύθερου Εμπορίου (European Free Trade Association – EFTA), ένα διεθνή Oργανισμό ο οποίος προάγει το ελεύθερο εμπόριο και την οικονομική ολοκλήρωση μεταξύ των κρατών μελών του και άλλων κρατών παγκοσμίως.

Το 1992, τα κράτη – μέλη υπέγραψαν συμφωνία με τον Ευρωπαϊκό Οικονομικό Χώρο (ΕΟΧ), στην οποία διακηρύσσεται η επιδίωξη για την προώθηση της αρμονικής ανάπτυξης του ΕΟΧ καθώς και η ανάγκη συμβολής του στη μείωση των οικονομικών και κοινωνικών ανισοτήτων μεταξύ των κρατών -μελών και των περιφερειών. Στο πλαίσιο της παραπάνω συμφωνίας, η οποία τέθηκε σε εφαρμογή το 1994, δημιουργήθηκαν ο Χρηματοδοτικός Μηχανισμός (Financial Mechanism) για την περίοδο 1994-1998 και το Χρηματοδοτικό Μέσο (Financial Instrument) για την περίοδο 1999-2003. Τόσο ο Μηχανισμός όσο και το Μέσο έχουν λειτουργήσει ως βραχείας διάρκειας ενισχυτικά εργαλεία συνοχής με σκοπό τη μείωση των οικονομικών και κοινωνικών ανισοτήτων μεταξύ των περιφερειών του ΕΟΧ.