Κατά συγκεκριμένων προσώπων και όχι κατά παντός υπευθύνου ασκήθηκαν τελικά οι ποινικές διώξεις για εννέα κακουργήματα και ένα πλημμέλημα από τον προϊστάμενο της Εισαγγελίας Εφετών Γιώργο Κολιοκώστα, για την υπόθεση των ομολόγων κατόπιν σχετικής παραγγελίας της Ολομέλειας Εφετών για την υπόθεση των ομολόγων.
Η δίωξη στρέφεται κατά των προσώπων που εντοπίζονται στα πορίσματα που παρέδωσαν για την υπόθεση οι εισαγγελείς εφετών κ. Αντώνης Λιόγας και Γρηγόρης Πεπόνης και αφορά στη χρονική περίοδο 1999 έως και 2007 πλην μιας πλημμεληματικής πράξης που αφορά στην περίοδο 2003 έως και 2007.
Η δίωξη περιλαμβάνει τα εξής αδικήματα:
Απάτη κατά συναυτουργία, κατά συρροή και μη, κατ' επάγγελμα και κατά συνήθεια.
Άμεση συνέργεια την απάτη.
Απιστία στην υπηρεσία κατά συναυτουργία και κατ' εξακολούθηση και με ιδιαίτερα τεχνάσματα τελεσθείσα υπό περιστάσεις ιδιαζόντως επιβαρυντικές.
Ηθική αυτουργία στις παραπάνω πράξεις.
Υπόθαλψη εγκληματιών - καταχραστών του Δημοσίου κατ' εξακολούθηση.
Παρασιώπηση εγκλημάτων καταχραστών του Δημοσίου κατ' εξακολούθηση.
Νομιμοποίηση εσόδων από εγκληματική δραστηριότητα κατ' επάγγελμα και κατ' εξακολούθηση.
Εγκληματική οργάνωση.
Φοροδιαφυγή έκδοση εικονικών φορολογικών στοιχείων κατ' εξακολούθηση και
Παράλειψη προϊσταμένων και επιθεωρητών για τον έλεγχο σε επιθεώρηση (πλημμέλημα).
Η ασκηθείσα δίωξη στρέφεται και κατά παντός άλλου αυτουργού ή συμμετόχου στα αδικήματα που ενδεχομένως προκύψουν από την ανάκριση. Η δίωξη θα διαβιβαστεί στους εφέτες κ. Λέκκα και Χοϊμέ οι οποίοι με απόφαση της Ολομέλειας Εφετών ανέλαβαν την διενέργεια κύριας ανάκρισης για την υπόθεση.

